回帖︰其餘小功能更新：
■ Siri語音助手支持希伯來語（Hebrew）、芬蘭語和馬來語，Siri支援語言總數達37種。
■ 支持iBooks通過iCloud同步PDF
■ 支持單台iPhone與多個Apple Watch配對
■ Wallet支持打開跳轉至其他相關App
■ 系統更多3D Touch功能，如天氣App、App Store、iTunes Store、股票App、健康App、指南針App和設置等。
■ Live Photos支持靜態照片，在「分享」點擊複製再選擇「以靜態照片複製」即可。
■ 支持美國Verizon用戶網絡使用Wi-Fi通話。
■ 解決1970年1月1日死機問題（回顧事件）。
■ 針對教育和企業可隱藏App圖案，僅支援Classroom app設定。
■ 更多Bug修復和性能改進
iOS9.3 支援設備
iPhone 4s、iPhone 5、Phone 5c、iPhone 5s、iPhone 6、iPhone 6 Plus、iPhone 6s和iPhone 6s Plus、第五代iPod touch、第六代iPod touch、iPad 2、第三代iPad、第四代iPad、iPad Air、iPad Air 2、iPad mini、iPad mini 2、iPad mini 3、iPad mini 4和iPad Pro。
正式版開放更新時間：
發表會結束後開放更新

Night Shift ： 日夜間切換
蘋果宣稱：「許多研究已顯示，晚上暴露在亮眼的藍光下，會影響人體的晝夜節奏，使我們更難以入睡。」為了改善此問題，蘋果將原本越獄上擁有的調整螢幕色溫工具f.lux佔為己有，變成自家iOS上功能，不清楚後續蘋果會針對此事如何處理，如此一來用戶可直接透過控制中心進行開關Night Shift模式，不過特別要注意是這項功能在比較舊款機種上無法支援。
Night Shift開關選項如下：
。現在馬上開啟
。開啟到明天
支援機種：
iPhone 5s
iPhone 6
iPhone 6 Plus
iPhone 6s
iPhone 6s Plus
iPod touch
iPad Air
iPad Air 2
iPad mini 2
iPad mini 3
iPad mini 4
iPad Pro

備忘錄App:密碼、指紋上鎖
許多用戶常會透過備忘錄記錄重要事情，在這次iOS9.3中替備忘錄加入了密碼和指紋加密保護功能，保護你的個人資料，包括各種財務詳情、醫療資訊或網站登入資訊等，都能安全無虞。你還可依製作日期、修改日期或字母順序為備忘錄進行排序，不過有用戶發現備忘錄有個漏洞，在點下HOME鍵後App還在後台執行，這時間內在開啟備忘錄功能是不需再輸入密碼就能進入，如此問題就要勤奮的關閉後台備忘錄才能確保安全。

健康App:更多數據顯示
這次健康App在功能上替體重、體能訓練及睡眠等類別，都加入全新的滑動選單，可顯示各種出色App，讓你輕鬆添加至「健康」控制台內，並且能夠將資料匯進到其他第三方App進行共享數據，不過該項分享數據功能目前還沒針對大多數國家開啟。

Apple CarPlay:加入音樂選單
CarPlay到至今發展的有點緩慢，台灣目前僅只有少數車種可以使用，不過在iOS9.3上替CarPlay加入了支援Apple Music上的「最新精選」與「為你推薦」功能，讓你除了可在iOS、OS X、PC上使用Apple Music外，連在車上也能享用這些功能。

Apple News 改進
Apple News到至今都還在台灣地區開放，除非將語言改為英文除外，這次更新中加入了For You功能，可依照用戶興趣提供相關內容，包括熱門話題與精選推薦內容，也新增橫向螢幕模式、文章內直接播放影片功能，在界面上有更簡潔設計調整。

結合教學課程
為了達成科技可以重塑教育計畫，蘋果針對教育上推出新的Apple School方案，針對iPad提供了多用戶帳號支援，包括有學生共享iPad、新的Classroom App、Apple School Manager以及管理Apple ID。

學生共享的iPad：
讓多位不同學生可在教室內共享iPad，學生能透過自己照片ID登入自己所屬帳號後，如此一來整個系統環境就會僅限該學生所有，便能存取自己的App、書籍與文件，每個帳號之間互相不會有所影響。
認識你的新助教(Classroom app)：
課堂上教師可透過AirPlay功能將授課講義、作業直接分享給學生，且能指定課堂上指定的App、網站或教科書，透過鎖定App功能讓學生保持專注。
Apple 教務管理功能(Apple School Manager)：
該功能是針對學校課程管理人員使用，可透過這網站能夠建立「受管理的 Apple ID」、登記學區 IT 管理人員、購買內容（App、電子書）、管理裝置登記（全校共用iPad設備），更可以安全存取你學區所有的重要登記資訊，只要連線至學生資訊系統，即可設定 IT 管理人員、建立帳戶，並尋找學生、教職員工與各個班級。
受管理的 Apple ID(Managed Apple ID)：
「受管理的 Apple ID」是專為學校而設計，可創建與指定AppleID，這些ID能讓你將文件儲存在 iCloud、登記 iTunes U 課程，和其他更多使用方式。